財政部要求農企業繳稅，引起全台農民團體反彈。農委會主委陳志清今在立院表示，現行不用繳稅、自立耕作的農民，未來希望不用繳稅，會和財部討論認定「自立耕作」和「營利事業」；財部次長許虞哲表示「只要有聘雇員工，就必須要繳納營所稅」；農民自己養牛銷售，沒有課稅問題，自立耕作都可以免稅，但如果成立公司，就要課稅。

立委林岱樺要求修法，主張農業的一級產業(如：養雞產蛋、養牛取奶)就不應該繳稅。林岱樺表示，酪農業、畜牧業即將可以依法進用外勞，一旦有員工，員工福利比照勞基法、有勞健保，就成為公司型態，除非有虧損，全部變成必須繳納營業稅的對象；但一級農產品生產不會賺錢，真正會賺錢的是第二級、第三 集的加工產業，農委會沒有捍衛農民權益，經濟部也不了解農民的特性，引起這麼大的反彈，經濟部和農委會官員應該「全部罰站」。林岱樺表示，政府鼓勵農民擴大經營規模，農民好不容易從一級產業要擴張為二級三級卻要課稅，建議修正所得稅法第11條，規定從事一級生產的農民，不論是否是公司都排除繳稅。

立委黃偉哲也質疑，若郭台銘也弄個有機農場做農產品生產，大公司從事一級產業生產，要不要課稅？一般農民生產牛奶做成乳製加工品，會對農民課稅嗎，認為未來認定將是很大問題。